آماده‌سازی صحیح شیر خشک برای حفظ سلامت و ایمنی نوزاد حیاتی است. همیشه باید دست‌ها و تمام وسایل مورد استفاده (شیشه شیر، سرپستانک، قاشق اندازه‌گیری) را به طور کامل ضدعفونی کنید. از آبی که به نقطه جوش رسیده و سپس تا دمای مناسب (معمولاً حدود ۴۰ درجه سانتیگراد) خنک شده است، استفاده نمایید. دستورالعمل درج‌شده روی قوطی شیر خشک را با دقت رعایت کنید؛ میزان دقیق پودر و آب بسیار مهم است. استفاده از پودر کمتر یا بیشتر می‌تواند به ترتیب منجر به سوءتغذیه یا مشکلات گوارشی و کلیوی برای نوزاد شود.

نگهداری شیر خشک نیز اصول خاص خود را دارد. شیر خشک آماده‌شده باید بلافاصله مصرف شود و در صورت عدم استفاده، حداکثر تا دو ساعت در دمای اتاق و در یخچال تا ۲۴ ساعت قابل نگهداری است. باقی‌مانده شیری که نوزاد از آن خورده است، به دلیل آلوده شدن به بزاق، باید دور ریخته شود. پودر شیر خشک خشک باید در مکانی خنک و خشک و دور از نور مستقیم آفتاب نگهداری شود و پس از باز کردن درب قوطی، محتویات آن باید ظرف یک ماه مصرف شود. رعایت این اصول، خطر رشد باکتری‌های مضر و ابتلای نوزاد به بیماری‌ها را به حداقل می‌رساند.